Las muestras de virus de personas con infecciones respiratorias graves, como la resfriado y el RSV, en el Reino Unido se analizarán de forma rutinaria mediante secuenciación de ADN en un plan que podría conducir a mejores tratamientos y vacunas, así como a una advertencia más temprana de nuevos brotes peligrosos. La tecnología se probará en hisopos nasales almacenados de las pruebas de covid-19 a partir de finales de este año, antiguamente de implementarse más ampliamente el próximo año.
El equipo detrás del plan, llamado Respiratory Virus and Microbiome Initiative, dice que no tiene conocimiento de ningún plan similar en otras partes del mundo, pero dilación que otros países adopten el mismo enfoque. Para fomentar esto, hará que todos los métodos y datos estén disponibles gratis.
“Esperamos que pueda estar de moda a nivel mundial”, dice Ewan Harrison del Instituto Wellcome Sanger en Cambridge, Reino Unido, quien lidera el plan.
Si proporcionadamente ha sido posible secuenciar genomas virales durante décadas, fue solo durante la pandemia de covid-19 que muchos países comenzaron a secuenciar de forma rutinaria miles de muestras, lo que reveló cómo el SARS-CoV-2, el virus detrás de la enfermedad, estaba evolucionando más rápido. que lo esperado. Entre otras cosas, esta vigilancia genómica permitió a los investigadores detectar las primeras variantes de omicron y predecir correctamente que provocarían una gran ola de casos en todo el mundo.
“Por primera vez en la historia de la humanidad, la genómica a gran escalera ha brindado a los gobiernos ya los formuladores de políticas una advertencia sobre lo que sucederá en una avalancha, y creo que es un cambio positivamente importante y profundo”, dice Harrison. “Es poco que creemos que es positivamente importante para seguir construyendo”.
Muchos otros virus, como el RSV, todavía pueden causar infecciones respiratorias graves, dice, pero nuestra comprensión de ellos es extremadamente limitada. “Distinto de una pequeña cantidad de secuenciación del genoma en los casos de resfriado, en existencia no existe ninguna vigilancia genómica de rutina de estos otros virus”, dice Harrison.
En la contemporaneidad, las pruebas comúnmente utilizadas para identificar los virus que causan infecciones graves solo revelan de qué tipo son, como rinovirus o adenovirus, dice Judith Breuer, viróloga del University College London.
La secuenciación del genoma completo de un virus revela mucha más información, que puede ser útil de muchas maneras. Para originarse, puede ayudar a respaldar que las personas reciban los tratamientos más efectivos. Algunos tratamientos de anticuerpos para covid-19 pueden ser menos efectivos contra variantes más nuevas, por ejemplo, por lo que los médicos pueden felicitar tratamientos alternativos de inmediato si saben que determinado tiene una de estas variantes.
Todavía puede conducir a mejores vacunas. Donado que la secuenciación del SARS-CoV-2 reveló que las variantes de omicron se habían extendido por todo el mundo y se habían vuelto dominantes, las inyecciones de refuerzo de ARNm se han actualizado para incluir dos de estas variantes, para que las vacunas sean más efectivas contra ellas.
La secuenciación genética todavía puede revelar cómo se propagan los virus y, por lo tanto, ayudar a contenerlos. Por ejemplo, si solo sabe que dos personas en cuidados intensivos tienen infecciones por rinovirus, no tendría idea si se infectaron en el hospital o en la comunidad, dice Breuer. La secuenciación puede decirnos si tienen exactamente el mismo virus y, por lo tanto, si es necesario mejorar las medidas de control de infecciones hospitalarias.
Por postrer, pero no menos importante, Harrison dilación detectar nuevas enfermedades emergentes desde el principio. Las probabilidades de hacer esto serán mucho mayores si otros países todavía realizan vigilancia genómica de rutina.
Secuenciar cualquiera de una docena o más de tipos diferentes de virus que pueden estar presentes en una muestra es técnicamente más difícil que solo secuenciar uno, especialmente cuando el objetivo es hacerlo usando una prueba baratura que podría estar de moda en cualquier parte del mundo. Es por eso que Harrison y su equipo perfeccionarán su enfoque utilizando hisopos almacenados antiguamente de comenzar a analizar hisopos frescos de pacientes en estado crítico en colaboración con la Agencia de Seguridad Sanitaria del Reino Unido. A espacioso plazo, la esperanza es expandir la vigilancia más allá de los que están gravemente enfermos y a otros tipos de virus.
Por ahora, los investigadores todavía planean secuenciar todo el material hereditario presente en algunas de las muestras de hisopos. Este enfoque, conocido como metagenómica, les permitirá identificar todo tipo de virus, bacterias y hongos presentes, lo que les permitirá estudiar el microbioma del tracto respiratorio.
“Los métodos y tecnologías que están desarrollando Ewan y Sanger serán extremadamente efectos”, dice Breuer. “Esta es una iniciativa increíblemente importante”.
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